Suite à la mort de Buffy, Angel est parti au Népal pour se remettre du décès de sa bien-aimée. A Los Angeles Wes, Gunn et Cordy continuent à sa battre contre les démons tandis que Fred reste enfermé dans la chambre jusqu’à ce que Angel revient. Toutefois, Cordy a de plus en plus de migraines à cause de ses visions, c’est à ce moment là qu’Angel s’aperçoit qu’il a des sentiments pour elle. Mais voilà que Darla revient enceinte jusqu’aux dents, et m’est Angel dans l’embarras car elle lui apprend que c’est lui le père. Pour couronner le tout, ils sont un chasseur de vampire du 18ième siècle, Hotlz, qui veut les éliminer car Angel dans le passé avait tué toute sa famille.
Les migraines de Cordy ne s’arrangent pas, skip un démon lui propose de changer de vie à condition de laisser tomber Angel. Elle refuse se compromis et se voit transformer en démon afin de pouvoir supporter ses visions. De leur côté, Gunn et Wes sont tous deux amoureux de Fred, cette dernière décide de choisir Gunn. De plus, pour le plus grand malheur d’Angel, Groosalugg réapparaît pour filer le parfait amour avec Cordy.
Suite à cette grossesse, de nombreux démons et le cabinet WOLFRAM & HART veulent l’enfant car le bébé est doté d’une âme. Pour sauver son enfant, Darla se sacrifie. Angel quand à lui se débarasse de tous les démons qui menace la vie de Connor, son fils.
Par la suite, Wesley découvre une prophétie qui annonce qu’Angel tuera Connor. Tous les signes annonciateurs de la prophétie apparaissent, Wes décide d’enlever Connor. Malheureusement, Justine (une jeune femme qui a été recruté par Hotlz) prend l’enfant et le donne à Hotlz et involontairement ils se retrouvent à Quathot une dimension démoniaque où personne ne peut aller les chercher. A partir de ce jour, tout est fini entre Wesley et Angel (Angel a même essayer de le tuer par vengeance).
Quelques temps plus tard, Connor réapparait, c’est devenu un ado, nommé Steven, et ayant pour pére Holtz mais il haït son véritable pére, Angel. Hotlz continue à formater une vengeance contre Angel, il demande à Connor d’aller vivre avec son vrai pére. Hotlz demande à Justine de le tuer en faisant croire que c’est Angel le coupable, Connor décide de venger cette mort.
Pendant ce temps, Cordy se rend compte qu’elle est amoureuse d’Angel. Groosalugg part ainsi que Lorne qui part vivre à Las Vegas.
Angel et Cordy se donnent rendez-vous, mais cette dernière est appelée par les puissances supérieures qui l’invitent à les rejoindre, elle accepte et finit par s’élever dans les cieux. Tandis qu’Angel se fait attaquer par Connor, il décide, avec l’aide de Justine, d’enfermer son pére dans un cercueil en métal qu’il jette dans les profondeurs d l’océan.